MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Klebsiella pneumoniae subsp. pneumoniae MGH 78578 chromosome

Total Repeats: 108354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009648	ACC	2	6	211	216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152968583
2	NC_009648	CAC	3	9	222	230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152968583
3	NC_009648	CGG	2	6	357	362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968584
4	NC_009648	CAGG	2	8	423	430	25 %	0 %	50 %	25 %	152968584
5	NC_009648	ACC	2	6	473	478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152968584
6	NC_009648	GAT	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152968584
7	NC_009648	GGC	2	6	505	510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968584
8	NC_009648	CTT	2	6	559	564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152968584
9	NC_009648	CTG	2	6	667	672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
10	NC_009648	CAT	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152968584
11	NC_009648	CTG	2	6	748	753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
12	NC_009648	CGC	2	6	853	858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968584
13	NC_009648	GCC	2	6	862	867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968584
14	NC_009648	CCG	2	6	911	916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968584
15	NC_009648	TGG	2	6	935	940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152968584
16	NC_009648	ACT	2	6	962	967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152968584
17	NC_009648	GCC	2	6	982	987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968584
18	NC_009648	GC	3	6	993	998	0 %	0 %	50 %	50 %	152968584
19	NC_009648	CTG	2	6	1002	1007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
20	NC_009648	GC	3	6	1066	1071	0 %	0 %	50 %	50 %	152968584
21	NC_009648	CTG	2	6	1072	1077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
22	NC_009648	AGG	2	6	1094	1099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152968584
23	NC_009648	TGC	2	6	1130	1135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
24	NC_009648	CGA	2	6	1236	1241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968584
25	NC_009648	CAA	2	6	1275	1280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152968584
26	NC_009648	CCGGG	2	10	1301	1310	0 %	0 %	60 %	40 %	152968584
27	NC_009648	GGC	2	6	1332	1337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968584
28	NC_009648	CCA	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152968584
29	NC_009648	GGT	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152968584
30	NC_009648	TCT	2	6	1393	1398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152968584
31	NC_009648	GCT	2	6	1494	1499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
32	NC_009648	ATC	2	6	1531	1536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152968584
33	NC_009648	GTG	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152968584
34	NC_009648	CAATAT	2	12	1608	1619	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	152968584
35	NC_009648	GAC	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968584
36	NC_009648	CCA	2	6	1682	1687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152968584
37	NC_009648	TCGGCG	2	12	1751	1762	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	152968584
38	NC_009648	CGG	2	6	1767	1772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968584
39	NC_009648	GCT	2	6	1776	1781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
40	NC_009648	CAG	2	6	1798	1803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968584
41	NC_009648	GAA	2	6	1812	1817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152968584
42	NC_009648	GCT	2	6	1863	1868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
43	NC_009648	GCC	2	6	1943	1948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968584
44	NC_009648	ACC	2	6	1970	1975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152968584
45	NC_009648	TCG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
46	NC_009648	CCAG	2	8	2006	2013	25 %	0 %	25 %	50 %	152968584
47	NC_009648	CAG	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968584
48	NC_009648	CGGCGA	2	12	2303	2314	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	152968584
49	NC_009648	CG	3	6	2348	2353	0 %	0 %	50 %	50 %	152968584
50	NC_009648	CTG	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
51	NC_009648	TCG	2	6	2438	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
52	NC_009648	GCC	2	6	2454	2459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968584
53	NC_009648	GCG	2	6	2474	2479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968584
54	NC_009648	GC	3	6	2545	2550	0 %	0 %	50 %	50 %	152968584
55	NC_009648	ATT	2	6	2687	2692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152968584
56	NC_009648	TGC	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
57	NC_009648	ACG	2	6	2735	2740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968584
58	NC_009648	CGG	2	6	2744	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968584
59	NC_009648	CTG	2	6	2767	2772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968584
60	NC_009648	GCG	2	6	2867	2872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968585
61	NC_009648	GCT	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968585
62	NC_009648	GCG	2	6	2921	2926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968585
63	NC_009648	A	7	7	3063	3069	100 %	0 %	0 %	0 %	152968585
64	NC_009648	GGT	2	6	3109	3114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152968585
65	NC_009648	CGCTG	2	10	3115	3124	0 %	20 %	40 %	40 %	152968585
66	NC_009648	GA	3	6	3186	3191	50 %	0 %	50 %	0 %	152968585
67	NC_009648	GCA	2	6	3210	3215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968585
68	NC_009648	GGC	2	6	3248	3253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968585
69	NC_009648	TGA	2	6	3261	3266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152968585
70	NC_009648	TCAG	2	8	3285	3292	25 %	25 %	25 %	25 %	152968585
71	NC_009648	TGA	2	6	3307	3312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152968585
72	NC_009648	CTG	2	6	3354	3359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968585
73	NC_009648	CGC	2	6	3389	3394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968585
74	NC_009648	GGC	2	6	3466	3471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968585
75	NC_009648	TGA	2	6	3477	3482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152968585
76	NC_009648	CTG	2	6	3515	3520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968585
77	NC_009648	GGC	2	6	3544	3549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968585
78	NC_009648	TG	3	6	3609	3614	0 %	50 %	50 %	0 %	152968585
79	NC_009648	GC	3	6	3654	3659	0 %	0 %	50 %	50 %	152968585
80	NC_009648	CGG	2	6	3708	3713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968585
81	NC_009648	CTGA	2	8	3854	3861	25 %	25 %	25 %	25 %	152968586
82	NC_009648	CGA	2	6	3865	3870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968586
83	NC_009648	GCA	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968586
84	NC_009648	GC	3	6	3964	3969	0 %	0 %	50 %	50 %	152968586
85	NC_009648	GCGTTT	2	12	3971	3982	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	152968586
86	NC_009648	GTAA	2	8	3992	3999	50 %	25 %	25 %	0 %	152968586
87	NC_009648	CGG	2	6	4063	4068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968586
88	NC_009648	GCG	2	6	4151	4156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968586
89	NC_009648	CG	3	6	4209	4214	0 %	0 %	50 %	50 %	152968586
90	NC_009648	CGG	2	6	4255	4260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968586
91	NC_009648	TGCC	2	8	4297	4304	0 %	25 %	25 %	50 %	152968586
92	NC_009648	GCC	2	6	4386	4391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968586
93	NC_009648	TAC	2	6	4409	4414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152968586
94	NC_009648	GCG	3	9	4421	4429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968586
95	NC_009648	CCG	2	6	4497	4502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968586
96	NC_009648	CTG	2	6	4505	4510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968586
97	NC_009648	CGC	2	6	4546	4551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968586
98	NC_009648	CCAACG	2	12	4554	4565	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	152968586
99	NC_009648	GCG	2	6	4590	4595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968586
100	NC_009648	CAGC	2	8	4645	4652	25 %	0 %	25 %	50 %	152968586
101	NC_009648	AAC	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152968586
102	NC_009648	CG	3	6	4665	4670	0 %	0 %	50 %	50 %	152968586
103	NC_009648	CCG	2	6	4684	4689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968586
104	NC_009648	GAT	2	6	4730	4735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152968586
105	NC_009648	ACC	2	6	4739	4744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152968586
106	NC_009648	AGC	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968586
107	NC_009648	GCG	2	6	4796	4801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968586
108	NC_009648	GC	4	8	4810	4817	0 %	0 %	50 %	50 %	152968586
109	NC_009648	AG	3	6	4885	4890	50 %	0 %	50 %	0 %	152968586
110	NC_009648	GGA	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152968586
111	NC_009648	CTGCCG	2	12	4916	4927	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	152968586
112	NC_009648	GCT	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968586
113	NC_009648	CGG	2	6	4977	4982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968586
114	NC_009648	CGC	2	6	4987	4992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968586
115	NC_009648	TGA	2	6	5004	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152968586
116	NC_009648	T	8	8	5348	5355	0 %	100 %	0 %	0 %	152968587
117	NC_009648	GGT	2	6	5356	5361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152968587
118	NC_009648	GCT	2	6	5376	5381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968587
119	NC_009648	ACA	2	6	5434	5439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152968587
120	NC_009648	ACC	2	6	5456	5461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	152968587
121	NC_009648	ACG	2	6	5507	5512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968587
122	NC_009648	AG	3	6	5530	5535	50 %	0 %	50 %	0 %	152968587
123	NC_009648	TAT	2	6	5540	5545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152968587
124	NC_009648	TGA	2	6	5661	5666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152968587
125	NC_009648	TTC	2	6	5669	5674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152968587
126	NC_009648	GTG	2	6	5687	5692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152968587
127	NC_009648	GCT	2	6	5865	5870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968588
128	NC_009648	AAT	2	6	5893	5898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	152968588
129	NC_009648	TCA	2	6	5907	5912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152968588
130	NC_009648	TTC	2	6	5924	5929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152968588
131	NC_009648	TTC	2	6	5960	5965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	152968588
132	NC_009648	TGA	2	6	6048	6053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152968588
133	NC_009648	TCG	2	6	6059	6064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968588
134	NC_009648	C	6	6	6108	6113	0 %	0 %	0 %	100 %	152968588
135	NC_009648	CG	3	6	6135	6140	0 %	0 %	50 %	50 %	152968588
136	NC_009648	GCA	2	6	6198	6203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968588
137	NC_009648	TGC	2	6	6233	6238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968588
138	NC_009648	GTC	2	6	6253	6258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968588
139	NC_009648	CTGC	2	8	6273	6280	0 %	25 %	25 %	50 %	152968588
140	NC_009648	GCG	2	6	6333	6338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968588
141	NC_009648	TCA	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152968588
142	NC_009648	GCT	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968588
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146	NC_009648	ATTC	2	8	6644	6651	25 %	50 %	0 %	25 %	152968589
147	NC_009648	GCC	2	6	6722	6727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968589
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151	NC_009648	ATT	2	6	6939	6944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152968589
152	NC_009648	CAG	2	6	6987	6992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968589
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154	NC_009648	ATC	2	6	7159	7164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152968589
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159	NC_009648	CGG	2	6	7214	7219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968589
160	NC_009648	CGG	3	9	7313	7321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968589
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162	NC_009648	TCG	2	6	7364	7369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968589
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165	NC_009648	GGA	2	6	7478	7483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152968589
166	NC_009648	CGC	3	9	7511	7519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968589
167	NC_009648	CCG	3	9	7523	7531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	152968589
168	NC_009648	CAG	2	6	7605	7610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968589
169	NC_009648	GAG	2	6	7611	7616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	152968589
170	NC_009648	CG	3	6	7655	7660	0 %	0 %	50 %	50 %	152968589
171	NC_009648	GGCCG	2	10	7671	7680	0 %	0 %	60 %	40 %	152968589
172	NC_009648	GCT	2	6	7743	7748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968589
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256	NC_009648	A	6	6	11824	11829	100 %	0 %	0 %	0 %	152968593
257	NC_009648	CGG	2	6	12090	12095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968594
258	NC_009648	GCG	2	6	12187	12192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968594
259	NC_009648	GCGT	2	8	12253	12260	0 %	25 %	50 %	25 %	152968594
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261	NC_009648	CAG	2	6	12327	12332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968594
262	NC_009648	TGC	2	6	12424	12429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968594
263	NC_009648	CTG	2	6	12447	12452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968594
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266	NC_009648	CAG	2	6	12513	12518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	152968594
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287	NC_009648	ACT	2	6	13675	13680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152968596
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387	NC_009648	CGG	2	6	17576	17581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968598
388	NC_009648	GAA	2	6	17644	17649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	152968598
389	NC_009648	GTGG	2	8	17697	17704	0 %	25 %	75 %	0 %	152968598
390	NC_009648	TGGC	2	8	17804	17811	0 %	25 %	50 %	25 %	152968598
391	NC_009648	CTG	2	6	17847	17852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968598
392	NC_009648	CTGAAG	2	12	17860	17871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	152968598
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395	NC_009648	GTC	2	6	18046	18051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968598
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401	NC_009648	GCG	2	6	18226	18231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968599
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407	NC_009648	CTG	2	6	18433	18438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968599
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420	NC_009648	GCT	2	6	18768	18773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968599
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426	NC_009648	ATT	2	6	19022	19027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	152968599
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433	NC_009648	TCAG	2	8	19794	19801	25 %	25 %	25 %	25 %	152968601
434	NC_009648	GTGC	2	8	19813	19820	0 %	25 %	50 %	25 %	152968601
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457	NC_009648	A	7	7	20889	20895	100 %	0 %	0 %	0 %	152968602
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481	NC_009648	ATCGA	2	10	22101	22110	40 %	20 %	20 %	20 %	152968602
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486	NC_009648	TGA	2	6	22594	22599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	152968602
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493	NC_009648	GGC	2	6	22826	22831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968602
494	NC_009648	GTG	2	6	22878	22883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	152968602
495	NC_009648	CAT	2	6	22934	22939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	152968602
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498	NC_009648	GCT	2	6	23180	23185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	152968602
499	NC_009648	CAA	2	6	23204	23209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	152968602
500	NC_009648	CGG	2	6	23243	23248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	152968602

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